Forskerne på Handelshøjskolen er primært organiseret i institutter, som afspejler det tidligere fakultets fagdiscipliner. Desuden indgår de fleste forskere i en eller flere forskergrupper. 

I forskergrupperne samarbejdes om et særligt forskningstema, som ofte går på tværs af institutternes forskningsområder. Forskergrupperne vil derfor bestå af forskere fra flere institutter og/eller andre institutioner.

Company Law
Koordinator: Paul Krüger Andersen

Corporate Governance
Koordinator: Mette Neville

Credo - Værdibaseret styring og ledelse
Koordinator: Verner C. Petersen

E-business Research Forum
Koordinator: Poul Houman Andersen

EU-Law
Koordinator: Karsten Engsig Sørensen

Finance Research Group
Forskningsgruppeleder: Peter Løchte Jørgensen

Forskergruppen for Oversættelse og tolkning
Koordinator: Karen Korning Zethsen

Forskergruppen for Videnskommunikation
Koordinator: Jan Engberg

Forum for Social Science Research concerning the Environment (In English)
Koordinator: John Thøgersen

Globalization and Industry Dynamics (GlobID)
Projektleder: Philipp J. H. Schröder

Information Systems Research Group
Forskningsgruppeleder: Andrea Carugati

Sprogsystem og sprogbrug
Koordinator: Torben Thrane

Tax Law
Koordinator: Aage Michelsen

Value of Intangibles
Koordinator: Kai Kristensen